Хотелось бы внедрить в нашу компанию электронный документооборот. Подскажите как правильно это будет сделать, чтобы не возникло ни каких проблем и багов.

Может кто-то из вас уже использует его?

В первую очередь вам надо внедрить электронную подпись https://www.esphere.ru/products/uc/ , чтобы вы могли подписывать документы в электронном формате. А потом уже и остальной документооборот будете приводить в электронный вид.